В настоящее время ФГУП «НПП ВНИИЭМ» представляет собой сложное многопрофильное предприятие, в структуру которого входят несколько научно-производственных комплексов и центров:научно-производственный комплекс «Космические комплексы»;научно-производственный комплекс «Космическая и комплексная силовая электромеханика»;научно-производственный комплекс «Электрооборудование и системы управления для АЭС»;научно-технический комплекс «Качество, научно-техническое и информационное обеспечение»;научно-производственный центр корабельного электромашиностроения;центр поддержки технологии и качества;центр инновационных технологий.Основными направлениями деятельности предприятия являются разработка и создание:космических комплексов и автоматических космических аппаратов, предназначенных для гидрометеорологического, природно-ресурсного и экологического мониторинга Земли, мониторинга техногенных и чрезвычайных природных катастроф, картографии;электромеханического оборудования для малых космических аппаратов различного назначения, в том числе аппаратуры для космических автоматических аппаратов и орбитальных станций;электрооборудования, систем управления и защиты ядерных реакторов АЭС, автоматизированных систем контроля и управления электрооборудованием и средств управляющей вычислительной техники;продукции электромашиностроения, в том числе разработка специальных электромашин и электродвигателей малой мощности;систем и электрооборудования для флота;специальных электромеханических устройств для газовой и нефтеперерабатывающей промышленности;медицинских аппаратов и оборудования.