Институт молекулярной биологии РАН проводит фундаментальные и прикладные исследования по следующим основным направлениям: – молекулярная и клеточная инженерия; биоинженерия; - онкогеномика, онкодиагностика, онкопрогностика, онковирусология; – молекулярная иммунология; – структура и молекулярная динамика биополимеров; – геномная и протеомная биоинформатика; - разработка фундаментальных основ новых молекулярных и клеточных технологий, бионанотехнологии; - приборостроение.