Федеральное агентство по рыболовству - федеральный орган исполнительной власти, созданный на основании Указа Президента Российской Федерации от 12 мая 2008 г. № 724 путём преобразования ранее существовавшего Государственного комитета Российской Федерации по рыболовству.
Постановлением Правительства Российской Федерации от 11 июня 2008 г. № 444 утверждено Положение о Федеральном агентстве по рыболовству.
В соответствии с п.12 Указа Президента Российской Федерации от 21 мая 2012 г. № 636 “О структуре федеральных органов исполнительной власти” Федеральное агентство по рыболовству находится в ведении Министерства сельского хозяйства Российской Федерации.
Распоряжением Правительства РФ от 17 января 2014 г. № 24-р Шестаков Илья Васильевич назначен заместителем Министра сельского хозяйства Российской Федерации - руководителем Федерального агентства по рыболовству.