Федеральное государственное унитарное предприятие "Государственный космический научно-производственный центр имени М.В.Хруничева" (ФГУП "ГКНПЦ имени М.В.Хруничева") был образован Распоряжением № 421-рп Президента РФ от 7 июня 1993 г. на базе двух ведущих предприятий ракетно-космической промышленности России – Машиностроительного Завода им. М.В.Хруничева и Конструкторского Бюро «Салют». Целью создания было сохранение, укрепление и развитие научно-технического потенциала, повышение эффективности работы промышленности в новых экономических условиях и выход на мировой космический рынок.
В соответствие со стратегией развития ракетно-космической промышленности, а также согласно Федеральной целевой программе “Реформирование и развитие оборонно-промышленного комплекса (2002-2006 гг.), утвержденной Постановлением Правительства РФ 11 октября 2001 года № 713 на базе ФГУП ГКНПЦ им. М.В. Хруничева было решено создать крупную интегрированную структуру в области разработки и создания ракет-носителей тяжелого класса. Важнейшая задача интеграции – сохранение существующего производственного и научно-технического потенциала предприятия, обеспечение выполнения государственных заказов, предусмотренных Федеральной космической программой.
3 февраля 2007 года Президент Российской Федерации В.В.Путин подписал указ «О федеральном государственном унитарном предприятии «Государственный космический научно-производственный центр имени М.В.Хруничева».
Предприятию потребовалось всего десять месяцев, чтобы под руководством Федерального космического агентства и Федерального агентства по управлению федеральным имуществом выполнить Указ Президента Российской Федерации о «О федеральном государственном унитарном предприятии «Государственный космический научно-производственный центр имени М.В.Хруничева», предусматривающий его реорганизацию в форме присоединения к нему четырех федеральных государственных унитарных предприятий в качестве филиалов.
29 декабря 2007 года вышли приказы Генерального директора о создании в составе ГКНПЦ им. М.В.Хруничева следующих филиалов – Производственное объединение «Полет», Московское предприятие по комплектованию оборудованием «Длина», Воронежский механический завод, а приказом от 16 января 2008 года – Конструкторское бюро химического машиностроения имени А.М.Исаева. Все процедуры были произведены в соответствии с Указом Президента Российской Федерации от 3.02.2007г. № 127 «О федеральном государственном унитарном предприятии «Государственный космический научно-производственный центр им. М.В.Хруничева» и распоряжением Правительства РФ от 19.02.2007г. № 185-р, а также зарегистрированным в установленном порядке Уставом федерального государственного унитарного предприятия «Государственный космический научно-производственный центр имени М.В.Хруничева».
В июне 2008 года ГКНПЦ имени М.В. Хруничева стал владельцем контрольного пакета акций ОАО «Протон-ПМ» (Пермь), которое специализируется на производстве жидкостных ракетных двигателей РД-276, используемых в качестве энергетической установки первой ступени ракеты- носителя тяжелого класса "Протон-М».
3 августа 2009 года Президент Российской Федерации Д.А. Медведев подписал Указ о передаче акций Конструкторского бюро химавтоматики в ведение ГКНПЦ имени М.В.Хруничева.
Открытое акционерное общество «Конструкторское бюро химавтоматики» (ОАО КБХА) - один из мировых лидеров в создании жидкостных ракетных двигателей, участник всех отечественных пилотируемых программ освоения космоса. КБХА сегодня - это современное научно-производственное объединение, которое способно обеспечить полный цикл создания жидкостных ракетных двигателей (ЖРД) для ракет оборонного, научного и народнохозяйственного назначения. Наряду с другими проектами по созданию новейших двигателей, КБХА разрабатывает жидкостной ракетный двигатель РД-0124А, который будет использоваться составе второй и третьей ступеней новейшей российской ракеты-носителя «Ангара» для выведения на орбиту КА тяжелого класса с космодромов России (головной разработчик РН «Ангара» -ГКНПЦ им. М.В. Хруничева).
В соответствии с Указом Президента Российской Федерации от 11 июня 2011 г. № 772 и распоряжением Правительства Российской Федерации от 7 июля 2011 г. № 1159-р Федеральное Государственное Унитарное Предприятие «Усть-Катавский вагоностроительный завод им. С.М.Кирова» преобразовано в филиал ФГУП «Государственный космический научно-производственный центр имени М.В. Хруничева».
В настоящее время в состав ФГУП "Государственный космический научно-производственный центр им. М.В.Хруничева" входят: Ракетно-космический завод (РКЗ), Конструкторское Бюро «Салют», Завод по эксплуатации ракетно-космической техники (ЗЭРКТ), Завод медицинской техники и товаров народного потребления (ЗМТ и ТНП).
Кроме того, предприятие имеет 9 филиалов, расположенных на территории 7 субъектов Российской Федерации – г.Москва и Московская, Владимирская, Омская, Челябинская, Воронежская, Архангельская области, а также в Республике Крым (пансионат «Планета») и 2 предприятия (ОАО Протон-ПМ и ОАО «Конструкторское бюро химавтоматики»), в которых ГКНПЦ им. М.В. Хруничева принадлежит контрольный пакет акций.
