ФГБУ «Управление «Самарамелиоводхоз» создано в соответствии с приказом Министерства сельского хозяйства и продовольствия Российской Федерации от 16 января 1997 г. № 182 «О специально уполномоченном государственном органе в области мелиорации земель в Самарской области» как Департамент по мелиорации земель и сельскохозяйственному водоснабжению Самарской области.
Основной целью деятельности учреждения является создание необходимых условий для увеличения объемов производства высококачественной продукции на основе восстановления и повышения плодородия почв земель сельскохозяйственного назначения при выполнении комплекса агрохимических, гидромелиоративных, культуртехнических, агролесомелиоративных, водохозяйственных и организационных мероприятий, эксплуатации мелиоративных систем.